實驗動物設施按功能分類為：實驗動物生產(chǎn)設施、實驗動物實驗設施、實驗動物特殊設施。

生產(chǎn)設施是指用于實驗動物繁育、生產(chǎn)的建筑物、設備及運營管理在內(nèi)的總和。

實驗動物實驗設施是指以研究、教學、實驗生物制品和藥品生產(chǎn)為目的，進行實驗動物飼育、實驗的建筑物及設備及運營管理在內(nèi)的總和。

設施等級是按照《實驗動物環(huán)境及設施(GB 14925-2010)》根據(jù)微生物控制將設施分為普通環(huán)境、屏障環(huán)境和隔離環(huán)境。

1、普通環(huán)境  普通環(huán)境設施是一種開放環(huán)境設施，飼育環(huán)境基本符合動物的生長、繁育要求，但不能完全控制傳染病、寄生蟲等其他干擾因子。目前嚙齒類實驗動物已經(jīng)取消普通環(huán)境下飼養(yǎng)，大動物飼育在普通環(huán)境設施下較多。

2、屏障環(huán)境  屏障設施主要用于清潔級、SPF級動物的飼育和動物實驗。有正壓屏障構造、負壓屏障構造(生物安全屏障系統(tǒng))，也有用層流架(正壓／負壓)或隔離器做SPF級屏障系統(tǒng)。是指在污染區(qū)和清潔區(qū)之間設有嚴格的屏障，即飼育環(huán)境是密閉的，通過屏蔽裝置與外界相通，送入飼養(yǎng)室內(nèi)的空氣要經(jīng)過初效、中效、高效三級過濾，潔凈度要求達到7級，除生物安全屏障系統(tǒng)為負壓以外，通常應保持為正壓，且不低于10Pa；排風口設有防空氣倒流裝置。送入的一切物品都要進行嚴格的消毒滅菌后，經(jīng)特制的傳遞裝置送入，進入屏障內(nèi)的工作人員也要進行嚴格的微生物控制。

3、隔離環(huán)境  隔離環(huán)境主要用來飼育無特定病原體、悉生以及無菌實驗動物。隔離環(huán)境設施內(nèi)的空氣、飼料、水、墊料等一切物品均為無菌，動物和物品經(jīng)過特殊傳遞，既保證了與外界隔離狀態(tài)，又能保持內(nèi)環(huán)境正常運轉。

對應設施，實驗動物按微生物學控制方法分類分級為四級:

一級動物:即普通動物,指飼養(yǎng)于開放系統(tǒng)或簡易屏障系統(tǒng),未經(jīng)積極的微生物控制的帶菌動物。但此類動物不同于非實驗用通常動物,它不得帶有人畜共患病病原體和嚴重危害動物種群的微生物和寄生蟲。

二級動物:即清潔動物.飼養(yǎng)于簡易屏障系統(tǒng)或屏障系統(tǒng)。其飼料、墊料、用具、空氣、人員服裝均已經(jīng)消毒處理。在一級動物微生物控制基礎上排除了危害本動物種群的徽生物和寄生蟲。

三級動物:即無特定病原體動物，指機體內(nèi)無特定的微生物和寄生蟲存在的動物。其由無菌動物而來,原則上不允許存在病原體,較二級動物控制要求更嚴格。

四級動物:即無菌動物。飼養(yǎng)于隔離系統(tǒng).機體內(nèi)無任何用現(xiàn)代監(jiān)測手段可檢出的寄生物(微生物和寄生蟲)或所有非植入的微生物和寄生蟲的動物。在自然界中不存在,必須用人為方法培育而成。